Kejaksan Negeri Sikka secara geografi  berada di Kota Maumere, Kabupaten Sikka, Provinsi Nusa Tenggara Timur tepatnya terletak di Jalan Jend. Sudirman, No. 10 berdampingan dengan Kodim 1603 Sikka.

Kabupaten Sikka terletak diantara 8°22′ sampai dengan 8°50′ derajat Lintang Selatan dan 121°55’40” sampai 122°41’30” Bujur Timur. Kabupaten Sikka merupakan bagian dari wilayah Provinsi Nusa Tenggara Timur yang terletak di Daratan Flores.

Total luas daratan Kabupaten Sikka mencapal 1.731,91 km2. Selain wilayah
darat, Kabupaten Sikka juga terdiri atas wilayah Kepulauan dengan jumlah 18 Pulau baik yang berpenghuni maupun yang tidak berpenghuni. Pulau terkecil adalah Pulau kambing (Pulau Pemana Kecil) yang luasnya tidak sampai 1 km2.

Batas-batas wilayah Kabupaten Sikka adalah sebagai berikut.

  •  Batas Utara    : Laut Flores
  •  Batas Selatan : Laut Sawu
  •  Batas Timur   : Kabupaten Flores Timur
  •  Batas Barat    : Kabupaten Ende